Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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HCN3Q9P1Z3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HCN3Q9P1Z3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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