Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A23Q9BV35 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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