Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms