Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
UBE2E2Q96LR5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms