Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM41Q8WV44 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms