Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms