Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms