Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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