Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms