Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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