Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ZFHX3Q15911 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms