Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms