Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL19A1Q14993 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms