Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMC2Q13753 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMC2Q13753 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms