Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms