Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms