Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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