Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BACE1P56817 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BACE1P56817 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms