Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM4SF4P48230 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms