Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAEP38570 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms