Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms