Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms