Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A6E-201ENST00000300182 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF4GP1-201ENST00000430567 1249 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073911.1-202ENST00000443154 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF101-204ENST00000444249 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108125.1-201ENST00000622310 543 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms