Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGIP1Q9BQI5 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms