Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms