Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRG4Q92954 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms