Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD1Q5SYB0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms