Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PHYHD1Q5SRE7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHYHD1Q5SRE7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms