Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCAF6Q58WW2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms