Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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