Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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