Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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