Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM32Q13049 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms