Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM2Q13029 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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