Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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