Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PAX8Q06710 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PAX8Q06710 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms