Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms