Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms