Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF6P49848 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF6P49848 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF6P49848 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF6P49848 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms