Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms