Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms