Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRGP23470 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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