Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TMEM225BP0DP42 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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