Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms