Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms