Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms