Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNAL1Q9UBT7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms