Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2TQ9NPD8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2TQ9NPD8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms