Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
VAT1Q99536 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms