Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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